MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 29248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019942	TCC	2	6	174916	174921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328124
3502	NC_019942	GTG	2	6	174992	174997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328124
3503	NC_019942	TAAA	2	8	175051	175058	75 %	25 %	0 %	0 %	432328124
3504	NC_019942	TCC	2	6	175158	175163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328124
3505	NC_019942	CCT	2	6	175242	175247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328124
3506	NC_019942	TCC	2	6	175442	175447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328124
3507	NC_019942	AT	4	8	175454	175461	50 %	50 %	0 %	0 %	432328124
3508	NC_019942	AT	3	6	175520	175525	50 %	50 %	0 %	0 %	432328124
3509	NC_019942	TGT	2	6	175617	175622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328124
3510	NC_019942	ATCT	2	8	175627	175634	25 %	50 %	0 %	25 %	432328124
3511	NC_019942	TCC	2	6	175644	175649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328124
3512	NC_019942	TC	3	6	175690	175695	0 %	50 %	0 %	50 %	432328124
3513	NC_019942	TCA	2	6	175718	175723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_019942	ACTC	2	8	175732	175739	25 %	25 %	0 %	50 %	432328125
3515	NC_019942	CATCC	2	10	175791	175800	20 %	20 %	0 %	60 %	432328125
3516	NC_019942	CTTC	2	8	175828	175835	0 %	50 %	0 %	50 %	432328125
3517	NC_019942	CAC	2	6	175893	175898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328125
3518	NC_019942	CCTTT	2	10	175918	175927	0 %	60 %	0 %	40 %	432328125
3519	NC_019942	CTT	2	6	175956	175961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328125
3520	NC_019942	AGG	2	6	175971	175976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328125
3521	NC_019942	TCA	2	6	175993	175998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328125
3522	NC_019942	GCT	2	6	176048	176053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328125
3523	NC_019942	CAAAA	2	10	176085	176094	80 %	0 %	0 %	20 %	432328125
3524	NC_019942	CAT	2	6	176139	176144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328125
3525	NC_019942	TC	4	8	176227	176234	0 %	50 %	0 %	50 %	432328126
3526	NC_019942	CAA	2	6	176355	176360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328127
3527	NC_019942	ACTC	2	8	176444	176451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_019942	GAT	2	6	176477	176482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_019942	AT	3	6	176554	176559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_019942	CT	3	6	176589	176594	0 %	50 %	0 %	50 %	432328128
3531	NC_019942	CACT	2	8	176595	176602	25 %	25 %	0 %	50 %	432328128
3532	NC_019942	TG	3	6	176681	176686	0 %	50 %	50 %	0 %	432328128
3533	NC_019942	GAT	2	6	176722	176727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328128
3534	NC_019942	CCG	2	6	176801	176806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432328129
3535	NC_019942	CCT	2	6	176810	176815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328129
3536	NC_019942	TG	3	6	176820	176825	0 %	50 %	50 %	0 %	432328129
3537	NC_019942	TC	4	8	176879	176886	0 %	50 %	0 %	50 %	432328129
3538	NC_019942	TCC	2	6	176906	176911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328129
3539	NC_019942	AGT	2	6	177066	177071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328130
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3541	NC_019942	ATCTC	2	10	177144	177153	20 %	40 %	0 %	40 %	432328130
3542	NC_019942	ATT	2	6	177172	177177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328130
3543	NC_019942	TAA	2	6	177197	177202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328130
3544	NC_019942	AAG	2	6	177279	177284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328130
3545	NC_019942	TAT	2	6	177290	177295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328130
3546	NC_019942	TGA	2	6	177317	177322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328130
3547	NC_019942	AAAG	2	8	177358	177365	75 %	0 %	25 %	0 %	432328130
3548	NC_019942	AAG	2	6	177435	177440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328130
3549	NC_019942	ATTG	2	8	177525	177532	25 %	50 %	25 %	0 %	432328130
3550	NC_019942	AG	3	6	177567	177572	50 %	0 %	50 %	0 %	432328130
3551	NC_019942	AAG	2	6	177582	177587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328130
3552	NC_019942	ATG	2	6	177604	177609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328130
3553	NC_019942	A	7	7	177645	177651	100 %	0 %	0 %	0 %	432328131
3554	NC_019942	GGGCC	2	10	177665	177674	0 %	0 %	60 %	40 %	432328131
3555	NC_019942	AGA	2	6	177712	177717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328131
3556	NC_019942	GAT	2	6	177743	177748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328131
3557	NC_019942	AG	3	6	177752	177757	50 %	0 %	50 %	0 %	432328131
3558	NC_019942	ACC	2	6	177762	177767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328131
3559	NC_019942	GAT	2	6	177782	177787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328131
3560	NC_019942	GAA	2	6	177948	177953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328131
3561	NC_019942	AGG	2	6	178009	178014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328131
3562	NC_019942	AAG	2	6	178015	178020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328131
3563	NC_019942	CCAC	2	8	178086	178093	25 %	0 %	0 %	75 %	432328131
3564	NC_019942	TGA	2	6	178127	178132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328131
3565	NC_019942	GAG	2	6	178164	178169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328131
3566	NC_019942	CTG	2	6	178183	178188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328131
3567	NC_019942	CTT	2	6	178195	178200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328131
3568	NC_019942	ATT	2	6	178299	178304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328131
3569	NC_019942	GAT	2	6	178305	178310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328131
3570	NC_019942	TTGGA	2	10	178315	178324	20 %	40 %	40 %	0 %	432328131
3571	NC_019942	GAA	2	6	178368	178373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328131
3572	NC_019942	AAAAG	2	10	178386	178395	80 %	0 %	20 %	0 %	432328131
3573	NC_019942	TAA	2	6	178498	178503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328131
3574	NC_019942	GAG	2	6	178504	178509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328131
3575	NC_019942	A	7	7	178512	178518	100 %	0 %	0 %	0 %	432328131
3576	NC_019942	A	6	6	178529	178534	100 %	0 %	0 %	0 %	432328131
3577	NC_019942	GCT	2	6	178548	178553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328131
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3581	NC_019942	TCT	2	6	178716	178721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328132
3582	NC_019942	CTTCAA	2	12	178736	178747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328132
3583	NC_019942	TA	4	8	178759	178766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_019942	CAC	2	6	178797	178802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_019942	AC	3	6	178801	178806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_019942	ATA	2	6	178816	178821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_019942	CCGT	2	8	178879	178886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_019942	T	7	7	178920	178926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_019942	TC	4	8	178993	179000	0 %	50 %	0 %	50 %	432328133
3590	NC_019942	TCT	2	6	179024	179029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328133
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3592	NC_019942	CT	3	6	179097	179102	0 %	50 %	0 %	50 %	432328133
3593	NC_019942	TC	4	8	179117	179124	0 %	50 %	0 %	50 %	432328133
3594	NC_019942	GGA	2	6	179216	179221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432328133
3595	NC_019942	TCCGC	2	10	179307	179316	0 %	20 %	20 %	60 %	432328133
3596	NC_019942	CCT	2	6	179317	179322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328133
3597	NC_019942	A	6	6	179325	179330	100 %	0 %	0 %	0 %	432328133
3598	NC_019942	GCT	2	6	179347	179352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328133
3599	NC_019942	CT	3	6	179351	179356	0 %	50 %	0 %	50 %	432328133
3600	NC_019942	CTTCGC	2	12	179414	179425	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	432328133
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3602	NC_019942	GAT	2	6	179504	179509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328133
3603	NC_019942	AATGC	2	10	179574	179583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3604	NC_019942	TC	3	6	179611	179616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_019942	T	6	6	179618	179623	0 %	100 %	0 %	0 %	432328134
3606	NC_019942	CCT	2	6	179635	179640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328134
3607	NC_019942	T	6	6	179646	179651	0 %	100 %	0 %	0 %	432328134
3608	NC_019942	ATC	2	6	179681	179686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328134
3609	NC_019942	CCA	2	6	179705	179710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328134
3610	NC_019942	CCA	2	6	179716	179721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432328134
3611	NC_019942	GAT	2	6	179741	179746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432328134
3612	NC_019942	TA	3	6	179764	179769	50 %	50 %	0 %	0 %	432328134
3613	NC_019942	AACC	2	8	179778	179785	50 %	0 %	0 %	50 %	432328134
3614	NC_019942	CTATTA	2	12	179790	179801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	432328134
3615	NC_019942	AT	3	6	179858	179863	50 %	50 %	0 %	0 %	432328134
3616	NC_019942	TCA	2	6	179864	179869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_019942	TATT	2	8	179879	179886	25 %	75 %	0 %	0 %	432328135
3618	NC_019942	T	7	7	179885	179891	0 %	100 %	0 %	0 %	432328135
3619	NC_019942	CTT	2	6	179895	179900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328135
3620	NC_019942	CAAC	2	8	179913	179920	50 %	0 %	0 %	50 %	432328135
3621	NC_019942	TTC	2	6	179921	179926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328135
3622	NC_019942	CTC	2	6	179951	179956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328135
3623	NC_019942	CT	4	8	179974	179981	0 %	50 %	0 %	50 %	432328135
3624	NC_019942	CAT	2	6	180073	180078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328135
3625	NC_019942	TAA	2	6	180079	180084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328135
3626	NC_019942	CT	3	6	180099	180104	0 %	50 %	0 %	50 %	432328135
3627	NC_019942	TGG	2	6	180127	180132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328135
3628	NC_019942	AAG	2	6	180268	180273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328135
3629	NC_019942	CTG	2	6	180306	180311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328135
3630	NC_019942	TC	3	6	180314	180319	0 %	50 %	0 %	50 %	432328135
3631	NC_019942	T	6	6	180430	180435	0 %	100 %	0 %	0 %	432328135
3632	NC_019942	TCTT	2	8	180477	180484	0 %	75 %	0 %	25 %	432328135
3633	NC_019942	GTG	2	6	180492	180497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432328135
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3640	NC_019942	CTT	2	6	180874	180879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432328135
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3643	NC_019942	T	6	6	180945	180950	0 %	100 %	0 %	0 %	432328135
3644	NC_019942	CAT	2	6	180998	181003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328136
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3653	NC_019942	CA	3	6	181625	181630	50 %	0 %	0 %	50 %	432328137
3654	NC_019942	ATCT	2	8	181660	181667	25 %	50 %	0 %	25 %	432328137
3655	NC_019942	CAT	2	6	181713	181718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328137
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3666	NC_019942	TTGCA	2	10	182318	182327	20 %	40 %	20 %	20 %	432328138
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3702	NC_019942	TGC	2	6	183884	183889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432328143
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3718	NC_019942	AT	3	6	184429	184434	50 %	50 %	0 %	0 %	432328144
3719	NC_019942	CAA	2	6	184451	184456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328144
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3721	NC_019942	ATCC	2	8	184626	184633	25 %	25 %	0 %	50 %	432328144
3722	NC_019942	TTTTA	2	10	184671	184680	20 %	80 %	0 %	0 %	432328144
3723	NC_019942	AATGC	2	10	184747	184756	40 %	20 %	20 %	20 %	432328144
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3731	NC_019942	TG	3	6	185078	185083	0 %	50 %	50 %	0 %	432328144
3732	NC_019942	TGT	3	9	185184	185192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328144
3733	NC_019942	TG	3	6	185274	185279	0 %	50 %	50 %	0 %	432328144
3734	NC_019942	ATC	2	6	185341	185346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328144
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3739	NC_019942	CAAC	2	8	185458	185465	50 %	0 %	0 %	50 %	432328145
3740	NC_019942	TAT	2	6	185474	185479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432328145
3741	NC_019942	AAG	2	6	185508	185513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432328145
3742	NC_019942	TCC	2	6	185591	185596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328145
3743	NC_019942	ATA	2	6	185687	185692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432328145
3744	NC_019942	TCC	2	6	185720	185725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432328145
3745	NC_019942	TCA	2	6	185844	185849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432328145
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3747	NC_019942	TTG	2	6	185937	185942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328145
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3997	NC_019942	AAGC	2	8	197617	197624	50 %	0 %	25 %	25 %	432328161
3998	NC_019942	AAC	2	6	197631	197636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432328161
3999	NC_019942	GCA	2	6	197915	197920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432328162
4000	NC_019942	TGT	2	6	197950	197955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432328162

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